明朝初年，张士诚余部后人陈玄机前往贺兰山刺杀二十年前叛主求荣的隐居高手云舞阳，途中遇到痴恋他的少女萧韵兰对其纠缠不休。萧韵兰的爱慕者、武当门人上官天野尾随而来，他误会陈玄机负心，欲令其与萧韵兰和好，不料却失手将陈玄机打伤。

　　陈玄机昏倒荒山，被少女云素素救回家里。陈玄机发觉云家布置竟和自己家中一样，并意外见到了外祖父家传的昆吾宝剑。素素善良聪慧多才多艺，两人一见钟情，但陈玄机很快得知她正是云舞阳之女，正自为难之际，上官天野忽然来到云家，原来他是武当掌门牟一粟的嫡传弟子，奉师傅遗命前来向云舞阳索要达摩剑谱。上官天野甘愿放弃追索剑谱来交换陈玄机，但遭云舞阳拒绝。云舞阳擒下上官天野囚入石室，意在创造机会让其参悟石室中的达摩剑谱，不明真相的陈玄机为救上官天野舍命刺杀云舞阳，云舞阳发觉女儿对陈玄机的情意而对他手下留情。

　　云舞阳有意重出江湖，成为朝廷和张士诚余部的拉拢对象，锦衣卫总指挥罗金峰，云舞阳的昔日同僚七修道人、石天铎等相继来到贺兰山。云舞阳为争天下第一高手之名强行与石天铎比武，将原已中毒受伤的石天铎杀死，引起了云夫人的鄙视，素素也为此伤心欲绝。一波未平一波又起，武当五老和“玉面残丐”毕凌风为达摩剑谱也先后来到云家。云舞阳打败了武当五老，却与毕凌风斗得两败俱伤。陈玄机欲营救上官天野，但发觉他已被毕凌风抢先一步救出，两人互诉心事，陈玄机言明自己所爱之人是素素而非萧韵兰，萧韵兰无意间听到后伤心离去。罗金峰欲乘机抓捕钦犯陈玄机，云舞阳夫妇为救女儿的恋人联手杀死罗金峰及其手下，但二人也伤重难治。云夫人临终前将素素托付给陈玄机，而云舞阳也只有三天之命。

　　上官天野得知武当五老谋取剑谱意在另立掌门，一气之下决意舍弃掌门之位，改而拜毕凌风为师。毕凌风临终前道出达摩剑谱背后的恩怨牵连，原来当年云素素的外祖父，前任武当掌门牟独逸为夺取剑谱杀死了陈玄机的外祖父陈定方，而云舞阳本是陈定方之婿，却于前妻死后再娶牟独逸之女，并盗走了达摩剑谱。

　　云舞阳在家中等候死亡的降临，萧韵兰之父、陈定方的弟子萧冠英追寻而至，正要杀云舞阳为好友毕凌风报仇，云舞阳的前妻陈雪梅突然出现。原来二十年前张士诚兵败长江时，云舞阳为求逃命，亲手将重伤的陈雪梅推下长江。当年的一念之差，使他二十年来深受良心责难，不料陈雪梅大难不死，并生下儿子陈玄机。云舞阳惊闻女儿的恋人竟是自己的亲生儿子，极度伤心之下心脏爆裂而死。素素乍闻种种隐情，承受不了意外的打击坠崖身亡，云家也在大火中化为灰烬，只留下陈玄机凄厉的狂叫声。